Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN3P07498 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN3P07498 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN3P07498 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN3P07498 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN3P07498 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN3P07498 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN3P07498 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN3P07498 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN3P07498 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN3P07498 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN3P07498 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN3P07498 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN3P07498 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN3P07498 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN3P07498 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN3P07498 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN3P07498 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN3P07498 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN3P07498 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN3P07498 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN3P07498 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN3P07498 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN3P07498 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN3P07498 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN3P07498 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN3P07498 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN3P07498 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN3P07498 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN3P07498 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN3P07498 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN3P07498 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN3P07498 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms