Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 PDE4C-206ENST00000594465 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 DIAPH3-201ENST00000267215 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TRIM62-201ENST00000291416 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MATN2-218ENST00000524308 3449 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 EDAR-203ENST00000409271 4323 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF286B-201ENST00000285274 5145 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SEPT6-205ENST00000394610 4694 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MYBPC3-201ENST00000256993 4217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MYBPC3-202ENST00000399249 4217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 LDLRAD3-201ENST00000315571 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RAD51D-202ENST00000345365 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SOCS4-204ENST00000555846 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AC098850.5-201ENST00000602730 3243 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RAVER1-201ENST00000293677 3595 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF473-205ENST00000595661 4828 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CNDP2-209ENST00000579847 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM214B-201ENST00000322813 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SETD4-201ENST00000332131 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SPATA13-204ENST00000399949 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AC073578.3-201ENST00000624926 4191 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 IL18BP-209ENST00000497194 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MFSD8-227ENST00000641393 4069 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ZC3H3-201ENST00000262577 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ALDH3A2-203ENST00000395575 3640 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MC1R-203ENST00000555427 3637 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MAPK1-201ENST00000215832 11022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CDH26-202ENST00000348616 3182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PDE6A-204ENST00000613228 5398 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 UBASH3A-201ENST00000291535 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 DGCR8-203ENST00000407755 4129 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RSPH3-202ENST00000367069 6561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM129A-201ENST00000367511 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF543-201ENST00000321545 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 IGSF9-202ENST00000368094 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 GBP6-201ENST00000370456 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SERPINA3-202ENST00000393080 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TTC30B-201ENST00000408939 4017 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AL080251.1-201ENST00000494072 4369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 GUCY1A3-207ENST00000511108 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 UBR1-202ENST00000546274 3332 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 FXR1-202ENST00000357559 8711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RBBP5-202ENST00000367164 4290 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PRR5L-201ENST00000378867 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SEMA4G-202ENST00000370250 3596 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 URGCP-202ENST00000402306 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TRPV3-201ENST00000301365 3235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 DDR1-238ENST00000446312 3202 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC24A1-212ENST00000546330 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SH2D4B-201ENST00000313455 2889 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 STX16-202ENST00000355957 4897 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AC004453.2-201ENST00000624861 2153 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 YAF2-201ENST00000327791 4156 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RAB37-201ENST00000340415 3804 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TUBB1-201ENST00000217133 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SAXO2-201ENST00000339465 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CLOCK-202ENST00000381322 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC22A2-201ENST00000366952 3737 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 NFKB1-205ENST00000505458 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CNTROB-202ENST00000563694 3705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PCDH12-201ENST00000231484 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 KLHL3-207ENST00000506491 6566 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC02504-201ENST00000512241 4949 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ASH2L-202ENST00000428278 2678 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM92A-206ENST00000518322 4241 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PHF8-204ENST00000357988 6024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 FLNB-212ENST00000490882 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MAST4-204ENST00000405643 7713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 GPR17-206ENST00000544369 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF23-201ENST00000357254 3186 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 SMARCAD1-204ENST00000457823 4649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.6 ms