Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 WARS-204ENST00000392882 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 DDX10-203ENST00000526794 6707 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RSPH4A-201ENST00000229554 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC9A8-202ENST00000417961 6309 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 KCNAB2-201ENST00000164247 4273 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 LIN54-203ENST00000446851 4083 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RC3H2-202ENST00000357244 3991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AL353593.1-201ENST00000602517 3955 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CATSPER2-203ENST00000396879 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 LASP1-204ENST00000435347 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 OR1I1-202ENST00000641398 5984 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 GMFB-209ENST00000616146 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 C2orf88-201ENST00000340623 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 NUP62-201ENST00000352066 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MCM3AP-202ENST00000397708 6333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 GOSR2-237ENST00000640443 3929 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SH3KBP1-203ENST00000379716 3819 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CABIN1-214ENST00000617531 7072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 FAN1-201ENST00000362065 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 HHAT-203ENST00000367010 3626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ATP1A3-208ENST00000545399 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 OR13A1-201ENST00000374401 2574 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 NPNT-202ENST00000379987 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MGLL-205ENST00000453507 4552 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF544-201ENST00000269829 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SYT10-201ENST00000228567 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ERCC6-208ENST00000515869 3439 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SEC23B-203ENST00000377465 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PRKCQ-203ENST00000539722 3224 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 HPSE2-203ENST00000370552 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 KCNAB1-201ENST00000302490 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ANXA11-202ENST00000372231 6720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MTSS1-205ENST00000518547 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TMEM87A-202ENST00000389834 3109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ANO3-201ENST00000256737 6642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PITRM1-AS1-201ENST00000430356 3998 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AL645608.3-201ENST00000448179 3043 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SEC14L3-201ENST00000215812 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PAX9-201ENST00000361487 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TGFBR1-209ENST00000552516 5933 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AC004490.1-201ENST00000585593 2738 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 YME1L1-207ENST00000477432 3474 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 METTL15-204ENST00000407364 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 LIMCH1-203ENST00000396595 5740 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF572-201ENST00000319286 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ACAN-208ENST00000561243 7593 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 KCNE1-206ENST00000432085 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CTNNA2-219ENST00000629316 3167 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 FITM2-201ENST00000396825 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 LAMA4-207ENST00000424408 5983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 STARD13-201ENST00000255486 5798 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 STARD13-204ENST00000399365 5784 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MCM6-201ENST00000264156 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 HS1BP3-202ENST00000402541 4358 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PSG6-209ENST00000601833 2321 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ARFGAP2-205ENST00000524782 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC38A3-206ENST00000614032 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 HEXIM1-201ENST00000332499 3600 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MIGA2-201ENST00000358369 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 DUSP27-202ENST00000361200 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC00910-202ENST00000586231 2890 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 NFE2L1-202ENST00000361665 4729 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SGSM2-211ENST00000574563 3410 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 POLR2J3-215ENST00000511313 4630 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 HIPK2-203ENST00000428878 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TOGARAM1-201ENST00000361462 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PARD3B-201ENST00000349953 3315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AL031686.1-201ENST00000472805 3876 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 DEF8-229ENST00000617948 3883 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.3 ms