Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms