Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS2Q9NRF8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms