Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms