Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms