Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms