Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms