Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms