Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms