Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAVIN3Q969G5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms