Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIBP1Q86W92 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms