Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMC6Q7Z403 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms