Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP4R4Q6NUP7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP4R4Q6NUP7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms