Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms