Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PXDC1Q5TGL8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms