Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms