Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A1Q15459 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SF3A1Q15459 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SF3A1Q15459 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SF3A1Q15459 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SF3A1Q15459 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SF3A1Q15459 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SF3A1Q15459 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SF3A1Q15459 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3A1Q15459 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3A1Q15459 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3A1Q15459 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3A1Q15459 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3A1Q15459 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3A1Q15459 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3A1Q15459 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3A1Q15459 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3A1Q15459 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3A1Q15459 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3A1Q15459 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3A1Q15459 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3A1Q15459 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3A1Q15459 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3A1Q15459 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3A1Q15459 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3A1Q15459 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3A1Q15459 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3A1Q15459 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SF3A1Q15459 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
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