Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 NAE1-213ENST00000564040 536 ntTSL 518.94■□□□□ 0.621e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 PAXBP1-204ENST00000443785 2920 ntTSL 1 (best)18.22■□□□□ 0.511e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.481e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 NAE1-212ENST00000563419 649 ntTSL 417.88■□□□□ 0.451e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 NAE1-220ENST00000569348 567 ntTSL 417.88■□□□□ 0.451e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 NAE1-208ENST00000562757 585 ntTSL 217.86■□□□□ 0.451e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 NAE1-222ENST00000569963 719 ntTSL 217.86■□□□□ 0.458e-10■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 NAE1-214ENST00000565535 580 ntTSL 517.86■□□□□ 0.451e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.391e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.261e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 TPR-205ENST00000474852 2757 ntTSL 1 (best)16■□□□□ 0.151e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 NAE1-218ENST00000567743 1460 ntTSL 1 (best)15.97■□□□□ 0.151e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.141e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.021e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 TRMT11-209ENST00000479748 2093 ntTSL 1 (best)14.88□□□□□ -0.031e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 XPO6-223ENST00000574435 765 ntTSL 514.6□□□□□ -0.071e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 MLXIP-210ENST00000541750 2835 ntTSL 514.42□□□□□ -0.12e-12■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.161e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.31e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.51e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 NDRG1-219ENST00000521544 709 ntTSL 511.81□□□□□ -0.521e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.651e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 XPO6-205ENST00000564337 605 ntTSL 510.77□□□□□ -0.691e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 HDLBP-235ENST00000476807 1070 ntTSL 510.38□□□□□ -0.751e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 NDRG1-215ENST00000520943 536 ntTSL 49.2□□□□□ -0.941e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 TLE1-205ENST00000464999 628 ntTSL 38.85□□□□□ -0.991e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 NAE1-205ENST00000561579 728 ntTSL 58.69□□□□□ -1.021e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 TLE1-206ENST00000491534 578 ntTSL 57.67□□□□□ -1.181e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 TPR-207ENST00000491783 882 ntTSL 55.88□□□□□ -1.474e-11■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 XPO6-210ENST00000566175 248 ntTSL 35.66□□□□□ -1.51e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 SLC38A2-204ENST00000548111 583 ntTSL 45.51□□□□□ -1.532e-18■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 SLC38A2-206ENST00000548785 578 ntTSL 34.71□□□□□ -1.662e-18■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 SLC38A2-202ENST00000546520 601 ntTSL 24.57□□□□□ -1.682e-18■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 NAE1-215ENST00000566336 686 ntTSL 54.43□□□□□ -1.71e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 SLC38A2-212ENST00000552703 528 ntTSL 24.38□□□□□ -1.712e-18■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 NAE1-211ENST00000563253 566 ntTSL 34.25□□□□□ -1.731e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 TRMT11-206ENST00000466316 729 ntTSL 54.2□□□□□ -1.741e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 XPO6-220ENST00000570294 520 ntTSL 43.19□□□□□ -1.91e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 PAXBP1-207ENST00000466846 3879 ntTSL 23□□□□□ -1.931e-9■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.854e-7■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 ATP13A2-204ENST00000463860 1639 ntTSL 217.37■□□□□ 0.374e-7■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 ATP13A2-207ENST00000502860 687 ntTSL 1 (best)15.62■□□□□ 0.094e-7■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 ATP13A2-209ENST00000506174 573 ntTSL 514.15□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.164e-7■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.434e-7■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 ATP13A2-201ENST00000326735 3840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.434e-7■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 PLOD3-209ENST00000460475 746 ntTSL 316.1■□□□□ 0.179e-10■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 RAB11FIP3-210ENST00000487899 669 ntTSL 310.15□□□□□ -0.784e-10■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 ACADVL-232ENST00000583074 410 ntTSL 516.69■□□□□ 0.261e-11■■■■■ 32.8
SF3B4Q15427 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.442e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 NDUFA13-202ENST00000502506 1166 ntTSL 214.28□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 NDUFA13-205ENST00000511180 593 ntTSL 214.21□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 NDUFA13-207ENST00000606722 502 ntTSL 311.65□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 NDUFA13-204ENST00000507754 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.72e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.269e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.139e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.148e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 MPND-205ENST00000596722 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 228.45■■■□□ 2.148e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 MPND-204ENST00000594716 1547 ntTSL 1 (best)28.33■■■□□ 2.138e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 MPND-206ENST00000597036 1445 ntTSL 526.97■■□□□ 1.918e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.888e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 TRAF7-206ENST00000569686 586 ntTSL 223.41■■□□□ 1.348e-7■■■■■ 32.7
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SF3B4Q15427 CCDC61-206ENST00000596687 800 ntTSL 522.74■■□□□ 1.238e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.168e-10■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 FAM171A2-202ENST00000588067 964 ntTSL 522.25■■□□□ 1.158e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.078e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.998e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.978e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.958e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 CCDC61-207ENST00000599044 849 ntTSL 220.77■□□□□ 0.928e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.918e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.98e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 MROH6-203ENST00000529971 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 520.16■□□□□ 0.827e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 SLC10A3-205ENST00000453912 1167 ntTSL 220.16■□□□□ 0.828e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.788e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.768e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 FAM171A2-204ENST00000592560 758 ntTSL 219.77■□□□□ 0.768e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.738e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.738e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.718e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 NUDT8-203ENST00000534054 1465 ntTSL 219.51■□□□□ 0.718e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.698e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.638e-10■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 NIPSNAP2-210ENST00000487370 494 ntTSL 318.84■□□□□ 0.618e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 AP5Z1-206ENST00000491375 786 ntTSL 518.74■□□□□ 0.598e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 MOB2-203ENST00000526698 608 ntTSL 318.55■□□□□ 0.568e-10■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.548e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 ABCA2-217ENST00000479446 6295 ntTSL 1 (best)18.16■□□□□ 0.58e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 NIPSNAP2-208ENST00000470036 497 ntTSL 217.94■□□□□ 0.468e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 NIPSNAP2-203ENST00000437587 818 ntTSL 517.93■□□□□ 0.468e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 LTK-205ENST00000563518 3444 ntTSL 217.91■□□□□ 0.468e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 UQCR11-204ENST00000593029 533 ntTSL 217.87■□□□□ 0.458e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 UQCR11-205ENST00000593264 409 ntTSL 317.68■□□□□ 0.428e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.428e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 C8orf33-203ENST00000529593 495 ntTSL 517.67■□□□□ 0.428e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 TBCD-209ENST00000572794 1380 ntTSL 217.34■□□□□ 0.378e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.328e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.38e-7■■■■■ 32.7
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