Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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