Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms