Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GNB1P62873 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNB1P62873 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNB1P62873 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNB1P62873 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNB1P62873 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNB1P62873 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNB1P62873 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNB1P62873 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNB1P62873 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNB1P62873 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNB1P62873 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNB1P62873 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNB1P62873 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNB1P62873 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNB1P62873 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNB1P62873 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNB1P62873 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNB1P62873 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNB1P62873 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNB1P62873 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNB1P62873 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNB1P62873 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNB1P62873 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNB1P62873 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNB1P62873 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNB1P62873 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNB1P62873 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNB1P62873 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNB1P62873 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GNB1P62873 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNB1P62873 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNB1P62873 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNB1P62873 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNB1P62873 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNB1P62873 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNB1P62873 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNB1P62873 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNB1P62873 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNB1P62873 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNB1P62873 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNB1P62873 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNB1P62873 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNB1P62873 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNB1P62873 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GNB1P62873 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNB1P62873 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms