Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms