Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB4P28070 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms