Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA21P01568 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms