Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms