Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E9PMD0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E9PMD0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E9PMD0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E9PMD0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E9PMD0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E9PMD0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E9PMD0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E9PMD0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E9PMD0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E9PMD0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E9PMD0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E9PMD0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E9PMD0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E9PMD0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PMD0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PMD0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PMD0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PMD0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PMD0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PMD0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PMD0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PMD0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PMD0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PMD0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PMD0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PMD0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PMD0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PMD0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PMD0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PMD0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PMD0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PMD0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PMD0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PMD0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PMD0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PMD0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PMD0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PMD0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PMD0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PMD0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PMD0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PMD0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PMD0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PMD0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PMD0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PMD0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PMD0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PMD0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PMD0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PMD0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PMD0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PMD0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PMD0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PMD0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PMD0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PMD0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PMD0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PMD0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PMD0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PMD0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PMD0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PMD0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PMD0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PMD0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PMD0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PMD0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PMD0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PMD0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PMD0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PMD0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PMD0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PMD0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PMD0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PMD0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PMD0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PMD0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PMD0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PMD0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PMD0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PMD0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PMD0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PMD0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PMD0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PMD0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PMD0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PMD0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PMD0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PMD0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PMD0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PMD0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PMD0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PMD0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PMD0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PMD0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PMD0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PMD0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PMD0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PMD0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PMD0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms