Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1445.6 ms