Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L4A6NEF3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms