Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERG28Q9UKR5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms