Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRMQ9NS64 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms