Protein–RNA interactions for Protein: Q9H790

EXO5, Exonuclease V, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO5Q9H790 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXO5Q9H790 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms