Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms