Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms