Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms