Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LIAT1Q6ZQX7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms