Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms