Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.1 ms