Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCAPD2Q15021 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAPD2Q15021 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms