Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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