Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSRP1Q08945 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms