Protein–RNA interactions for Protein: Q02127

DHODH, Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHODHQ02127 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DHODHQ02127 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms