Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PAX9P55771 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PAX9P55771 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PAX9P55771 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PAX9P55771 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PAX9P55771 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PAX9P55771 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX9P55771 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX9P55771 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX9P55771 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX9P55771 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX9P55771 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX9P55771 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX9P55771 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX9P55771 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX9P55771 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX9P55771 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX9P55771 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX9P55771 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX9P55771 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX9P55771 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX9P55771 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX9P55771 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX9P55771 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX9P55771 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX9P55771 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX9P55771 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX9P55771 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX9P55771 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX9P55771 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX9P55771 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX9P55771 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX9P55771 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms