Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms