Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms