Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms