Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms