Protein–RNA interactions for Protein: P01562

IFNA1, Interferon alpha-1/13, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA1P01562 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA1P01562 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms