Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF879B4DU55 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms